MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Halovivax ruber XH-70

Total Repeats: 83712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019964	CGA	2	6	128	133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019964	GCG	2	6	136	141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019964	ATC	2	6	143	148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019964	ACG	2	6	175	180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019964	GAC	2	6	188	193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
6	NC_019964	ACGA	2	8	203	210	50 %	0 %	25 %	25 %	433637029
7	NC_019964	GAG	2	6	254	259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637029
8	NC_019964	GACG	2	8	268	275	25 %	0 %	50 %	25 %	433637029
9	NC_019964	CGAGT	2	10	277	286	20 %	20 %	40 %	20 %	433637029
10	NC_019964	CGA	2	6	298	303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
11	NC_019964	GTG	2	6	312	317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433637029
12	NC_019964	CGT	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
13	NC_019964	CAA	2	6	394	399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637029
14	NC_019964	CGA	2	6	405	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
15	NC_019964	ACGGGA	2	12	467	478	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	433637029
16	NC_019964	TCG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
17	NC_019964	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
18	NC_019964	CGA	2	6	643	648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
19	NC_019964	ATCG	2	8	688	695	25 %	25 %	25 %	25 %	433637029
20	NC_019964	ACG	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
21	NC_019964	CGA	2	6	732	737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
22	NC_019964	CGA	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
23	NC_019964	CGG	2	6	768	773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
24	NC_019964	GAC	2	6	812	817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
25	NC_019964	CGA	2	6	823	828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
26	NC_019964	AGG	2	6	879	884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637029
27	NC_019964	GAC	2	6	908	913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
28	NC_019964	CGG	2	6	919	924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
29	NC_019964	CGA	2	6	949	954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
30	NC_019964	TCGA	2	8	995	1002	25 %	25 %	25 %	25 %	433637029
31	NC_019964	GAC	2	6	1034	1039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
32	NC_019964	GAA	2	6	1052	1057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
33	NC_019964	CCGA	2	8	1076	1083	25 %	0 %	25 %	50 %	433637029
34	NC_019964	TCT	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433637029
35	NC_019964	ACT	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637029
36	NC_019964	TCG	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
37	NC_019964	AGA	2	6	1170	1175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
38	NC_019964	GCG	2	6	1176	1181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
39	NC_019964	CG	3	6	1230	1235	0 %	0 %	50 %	50 %	433637029
40	NC_019964	CG	3	6	1287	1292	0 %	0 %	50 %	50 %	433637029
41	NC_019964	GAA	2	6	1310	1315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637029
42	NC_019964	ACG	2	6	1335	1340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
43	NC_019964	GCG	2	6	1427	1432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637029
44	NC_019964	CGC	2	6	1435	1440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637029
45	NC_019964	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	433637029
46	NC_019964	TCG	2	6	1524	1529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
47	NC_019964	CGT	2	6	1573	1578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
48	NC_019964	GTC	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
49	NC_019964	ATC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637029
50	NC_019964	ACA	2	6	1680	1685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637029
51	NC_019964	GCGTC	2	10	1732	1741	0 %	20 %	40 %	40 %	433637029
52	NC_019964	TCA	2	6	1749	1754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637029
53	NC_019964	CGT	3	9	1786	1794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637029
54	NC_019964	TCC	2	6	1863	1868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433637029
55	NC_019964	CGA	2	6	1894	1899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637029
56	NC_019964	TTCG	2	8	1962	1969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019964	TTC	2	6	1978	1983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019964	C	6	6	1995	2000	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_019964	CAG	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019964	TGC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019964	CGT	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019964	GGA	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019964	CGA	2	6	2183	2188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019964	CGC	2	6	2217	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637030
65	NC_019964	CCG	3	9	2235	2243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637030
66	NC_019964	GCG	2	6	2247	2252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637030
67	NC_019964	TGC	2	6	2258	2263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
68	NC_019964	CGGG	2	8	2269	2276	0 %	0 %	75 %	25 %	433637030
69	NC_019964	CGT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
70	NC_019964	GAC	2	6	2369	2374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
71	NC_019964	C	6	6	2414	2419	0 %	0 %	0 %	100 %	433637030
72	NC_019964	CGT	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
73	NC_019964	GCC	2	6	2588	2593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637030
74	NC_019964	GAT	2	6	2603	2608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637030
75	NC_019964	CG	3	6	2657	2662	0 %	0 %	50 %	50 %	433637030
76	NC_019964	CGA	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
77	NC_019964	CGA	3	9	2716	2724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
78	NC_019964	TGC	2	6	2758	2763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
79	NC_019964	CCA	2	6	2776	2781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637030
80	NC_019964	CGG	2	6	2783	2788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637030
81	NC_019964	GAC	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
82	NC_019964	CGT	2	6	2911	2916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
83	NC_019964	GACC	2	8	2927	2934	25 %	0 %	25 %	50 %	433637030
84	NC_019964	TCGG	2	8	2950	2957	0 %	25 %	50 %	25 %	433637030
85	NC_019964	TCG	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
86	NC_019964	CGT	3	9	3037	3045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637030
87	NC_019964	CGA	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637030
88	NC_019964	TCGG	2	8	3168	3175	0 %	25 %	50 %	25 %	433637030
89	NC_019964	GCA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019964	CGAG	2	8	3409	3416	25 %	0 %	50 %	25 %	433637031
91	NC_019964	GCT	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
92	NC_019964	TCGA	2	8	3462	3469	25 %	25 %	25 %	25 %	433637031
93	NC_019964	GGC	2	6	3700	3705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637031
94	NC_019964	G	6	6	3725	3730	0 %	0 %	100 %	0 %	433637031
95	NC_019964	ACCGGG	2	12	3797	3808	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	433637031
96	NC_019964	TCGAC	2	10	3841	3850	20 %	20 %	20 %	40 %	433637031
97	NC_019964	ACC	2	6	3882	3887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433637031
98	NC_019964	TCGA	2	8	3899	3906	25 %	25 %	25 %	25 %	433637031
99	NC_019964	CGG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637031
100	NC_019964	GAT	2	6	3934	3939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637031
101	NC_019964	CTGG	2	8	3979	3986	0 %	25 %	50 %	25 %	433637031
102	NC_019964	TTTCC	2	10	4013	4022	0 %	60 %	0 %	40 %	433637031
103	NC_019964	TGA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637031
104	NC_019964	TCG	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
105	NC_019964	ACGAG	2	10	4069	4078	40 %	0 %	40 %	20 %	433637031
106	NC_019964	CGA	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
107	NC_019964	TCG	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
108	NC_019964	CCG	2	6	4176	4181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637031
109	NC_019964	GAG	2	6	4280	4285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637031
110	NC_019964	CAT	2	6	4369	4374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637031
111	NC_019964	TGA	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637031
112	NC_019964	ACG	2	6	4461	4466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
113	NC_019964	GAG	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637031
114	NC_019964	CGAT	2	8	4511	4518	25 %	25 %	25 %	25 %	433637031
115	NC_019964	CGA	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
116	NC_019964	ACG	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
117	NC_019964	GCT	2	6	4678	4683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
118	NC_019964	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	433637031
119	NC_019964	CGG	2	6	4711	4716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637031
120	NC_019964	GTCC	2	8	4762	4769	0 %	25 %	25 %	50 %	433637031
121	NC_019964	ACG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637031
122	NC_019964	GCT	2	6	4845	4850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
123	NC_019964	AGA	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433637031
124	NC_019964	TCG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637031
125	NC_019964	TC	3	6	4976	4981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_019964	GA	3	6	5125	5130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019964	TGC	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019964	GA	3	6	5221	5226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019964	GA	3	6	5228	5233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019964	GA	3	6	5240	5245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019964	C	6	6	5300	5305	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_019964	CGA	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019964	TTA	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019964	ATG	2	6	5377	5382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019964	TGG	2	6	5428	5433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019964	GTT	2	6	5439	5444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019964	TGT	2	6	5470	5475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019964	TCC	2	6	5554	5559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019964	GGTGG	2	10	5633	5642	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019964	TCC	2	6	5647	5652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_019964	GAC	2	6	5661	5666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019964	GTG	2	6	5677	5682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019964	CGAT	2	8	5752	5759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_019964	TCA	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019964	ACTC	2	8	5867	5874	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_019964	CT	3	6	5970	5975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_019964	TCTG	2	8	5990	5997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_019964	G	6	6	6019	6024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019964	GGA	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019964	CAT	2	6	6063	6068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_019964	CA	3	6	6079	6084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_019964	TCGG	2	8	6152	6159	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_019964	CTCA	2	8	6168	6175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_019964	AGG	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019964	TC	3	6	6300	6305	0 %	50 %	0 %	50 %	433637032
156	NC_019964	ACCG	2	8	6311	6318	25 %	0 %	25 %	50 %	433637032
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158	NC_019964	GAC	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
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160	NC_019964	ACTGG	2	10	6408	6417	20 %	20 %	40 %	20 %	433637032
161	NC_019964	CG	4	8	6461	6468	0 %	0 %	50 %	50 %	433637032
162	NC_019964	CGAT	2	8	6513	6520	25 %	25 %	25 %	25 %	433637032
163	NC_019964	TCG	2	6	6522	6527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637032
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165	NC_019964	GAG	2	6	6560	6565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637032
166	NC_019964	CGA	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
167	NC_019964	GAC	2	6	6587	6592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
168	NC_019964	GGA	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433637032
169	NC_019964	ATC	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637032
170	NC_019964	CG	3	6	6741	6746	0 %	0 %	50 %	50 %	433637032
171	NC_019964	CGA	2	6	6784	6789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
172	NC_019964	GCA	2	6	6823	6828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637032
173	NC_019964	GAAG	2	8	6850	6857	50 %	0 %	50 %	0 %	433637032
174	NC_019964	ACA	2	6	6861	6866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637032
175	NC_019964	ACA	2	6	6882	6887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433637032
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179	NC_019964	CGA	2	6	7069	7074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637033
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186	NC_019964	TC	3	6	7290	7295	0 %	50 %	0 %	50 %	433637033
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209	NC_019964	ATC	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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237	NC_019964	GAC	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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239	NC_019964	GTC	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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253	NC_019964	C	6	6	9963	9968	0 %	0 %	0 %	100 %	433637037
254	NC_019964	GGT	2	6	10085	10090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
255	NC_019964	CAC	2	6	10100	10105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
256	NC_019964	GGT	2	6	10107	10112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019964	TC	3	6	10133	10138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
258	NC_019964	ACCG	2	8	10205	10212	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
259	NC_019964	GGC	2	6	10356	10361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637038
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263	NC_019964	CGA	2	6	10572	10577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637038
264	NC_019964	CGT	2	6	10593	10598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637038
265	NC_019964	CGAT	2	8	10634	10641	25 %	25 %	25 %	25 %	433637038
266	NC_019964	CTA	2	6	10665	10670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433637038
267	NC_019964	CGC	2	6	10671	10676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433637038
268	NC_019964	GA	3	6	10697	10702	50 %	0 %	50 %	0 %	433637038
269	NC_019964	TCCG	2	8	10715	10722	0 %	25 %	25 %	50 %	433637038
270	NC_019964	GGC	2	6	10723	10728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637038
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273	NC_019964	CGA	2	6	10905	10910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637038
274	NC_019964	CGA	2	6	10926	10931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637038
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277	NC_019964	GACT	2	8	11104	11111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
278	NC_019964	TCCT	2	8	11139	11146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
279	NC_019964	GTCG	2	8	11151	11158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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282	NC_019964	GT	3	6	11281	11286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019964	AAG	2	6	11375	11380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_019964	CGG	2	6	11465	11470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_019964	GCCG	2	8	11503	11510	0 %	0 %	50 %	50 %	433637039
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303	NC_019964	GT	4	8	12082	12089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
304	NC_019964	CTG	2	6	12098	12103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
305	NC_019964	GTC	2	6	12107	12112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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309	NC_019964	CGA	2	6	12269	12274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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311	NC_019964	CGT	2	6	12334	12339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_019964	CCGC	2	8	12454	12461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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346	NC_019964	GCA	2	6	13836	13841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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379	NC_019964	CGGG	2	8	15156	15163	0 %	0 %	75 %	25 %	433637041
380	NC_019964	CGT	2	6	15206	15211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433637041
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382	NC_019964	GCA	2	6	15255	15260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637041
383	NC_019964	GGC	2	6	15271	15276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637041
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388	NC_019964	CGG	3	9	15449	15457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433637041
389	NC_019964	TGA	2	6	15463	15468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433637041
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391	NC_019964	TCGCCG	2	12	15598	15609	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433637041
392	NC_019964	CGGG	2	8	15643	15650	0 %	0 %	75 %	25 %	433637041
393	NC_019964	CGA	2	6	15656	15661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637041
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395	NC_019964	ACG	2	6	15684	15689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433637041
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